肛瘘和痔疮完全是两个疾病。痔疮是血管性疾病，主要是由于静脉、淋巴回流不好而引起的血管扩张、增生，形成痔核。肛瘘是感染性疾病，其是由肛窦，即肛门里大概1.5cm，皮肤和黏膜交界处有一圈肛窦组织发生的感染。其先形成肛周脓肿，然后破溃形成管道，因为脓液从肛窦里产生，从外口破溃的地方流出，慢慢形成窦道，这时称为肛瘘。所以痔疮和肛瘘完全是两种疾病，一个是血管性疾病，一个是感染性疾病。
肛瘘和痔疮的临床表现也完全不同。痔疮主要表现为出血、疼痛、瘙痒，而肛瘘主要表现为肛周破溃口的流脓、渗液和潮湿、瘙痒，所以其治疗上也不同。
