三叉神经疼主要根据病因进行治疗，如果是继发性，比如肿瘤、血管压迫三叉神经，需要解决继发性原因；如果有肿瘤则行肿瘤切除术；如果是血管受压，行血管微血管减压。
如果没有原因而出现三叉神经痛，称为原发性三叉神经痛，首选抗癫痫类药物，比如卡马西平、奥卡西平加镇痛药物，包含非甾体药物曲马多类，还有吗啡类制剂。
如果药物治疗效果不好时，患者需要到疼痛科就诊，行三叉神经节半月神经节阻滞，大部分患者可以消除疼痛，因为其病因主要是炎性疼痛。如果阻滞有效果，但是维持时间不长，可以行三叉神经半月神经节射频毁损。可以靠温度破坏半月神经节，使疼痛传导路径不能传到大脑，患者感知不到疼痛，从而使疼痛得到缓解。现在更新的方法是做三叉神经球囊压迫，靠球囊把半月神经节压迫缺血坏死，从而达到缓解疼痛的目的。
