脑动脉栓塞的栓子最常见的来源是心脏，具体如下：
1、慢性房颤：由于心房的附壁血栓脱落而引起栓塞；
2、血管粥样硬化：即由于血管内的粥样硬化斑块脱落造成；
3、心内膜炎：主要见于亚急性感染性心内膜炎，从而导致心脏瓣膜上的部分细菌性栓子脱落，同样可以引起脑动脉栓塞。
除此之外，脑动脉栓塞还可以有其他来源，比如长骨骨折，骨髓腔内的一些脂肪随血液进入脑动脉，也可以造成脑动脉的脂肪性栓塞。还有全身其他部位的恶性肿瘤，肿瘤性的栓子通过血管进入到颅内，也可造成脑动脉的栓塞，另外还可以见到如气栓等情况所造成的栓塞。
总体来说，脑动脉的栓塞来源可以分为以上几类。当然，脑动脉栓塞的最常见部位，是大脑中动脉的供血区部位，因为大脑中动脉是颈内动脉末端的直接延续。
