撒尿有点痛原因如下：

1、尿液结晶摩擦：可能是尿液中的结晶摩擦尿道黏膜引起的疼痛，因为尿液不是单纯的水，尿液含有很多代谢的产物。尿少的时候，这些产物会形成结晶沉淀在膀胱中。所以在排尿的时候，可能会摩擦尿道引起疼痛感；

2、结石：有些细小的结石可能容易自己排出，并摩擦尿道产生疼痛。要观察有没有血尿，可以做一个尿常规检查，观察尿常规是否有问题，如是否有红细胞、白细胞等。如果尿常规检查正常，就不用担心疼痛是异常现象。至少可以排除感染结石的可能，可能需要多喝水、多排尿、增加尿量，稀释尿液中的代谢产物，就可以减少疼痛的发生；

3、泌尿系感染：如果尿液中有白细胞的存在，可能提示有泌尿系感染。可以使用抗生素进行治疗，常用的如头孢类、喹诺酮类、四环素类等，都是比较常用的治疗尿道炎的抗生素，可以消除感染，消除尿道中的炎症就可以改善疼痛的症状。

所以出现轻微尿痛，一般没有太大关系，多喝水也许就能够改善。当然也可以做一个尿常规检查，排除有没有感染、结石的可能。如果没有什么疾病，就没有关系，多喝水即可。