小肠间质瘤终身不复发，可能指的是低潜能的良性间质瘤，而不是恶性间质瘤。间质瘤在胃和小肠较多见，此时称为胃肠道间质瘤。间质瘤性质与生物学特性有关，也分恶性和良性，根据间质瘤的大小、核分裂象、CT117阳性率等判定恶性程度、侵蚀性。
部分小肠间质瘤为良性间质瘤，体积较小且核分裂象较少，为良性疾病，所以手术后不会复发。但如果是恶性间质瘤，或体积较大、手术中已有破溃，此时易复发和转移，即使服用格列卫等间质瘤用药，也不能完全抵抗恶性肿瘤的复发和转移。此外，较多术前检查如CT、核磁共振等，可诊断间质瘤的恶性程度。
