奥利司他胶囊的主要副作用是排油。奥利司他胶囊主要作用于肠道，能抑制脂肪吸收。即在食用了油餐后，脂肪可以随大便排出去，所以服用奥利司他胶囊时，可以垫护垫，相对而言女生比男性会方便一些。有些人在服用该药物之后大便里或是排气时出油，可能会弄到内衣或者裤子上，较影响美观。

但也正是利用奥利司他胶囊排油的作用来减重和逆转血糖，作用和副作用两者并行，若是不抑制排油，则也无法发挥其作用。