流行性乙型脑炎最主要的传染源是蚊虫，研究得比较多的是三带喙库蚊。除了三带喙库蚊之外，研究发现还有其它种类的蚊虫，也是流行性乙型脑炎最重要的传染源。
流行性乙型脑炎是虫媒传染的脑炎，除了三带喙库蚊，还有猪、涉水的飞禽，也是这个病毒存在的重要环境。通常三带喙库蚊在叮咬了携带有病毒的猪，或者是这些涉水的鸟类，再去叮咬人的情况下，人就成为这个病毒的最终宿主，从而出现流行性乙型脑炎。
但是人身上携带的病毒载量通常比较小，因此在这样的情况下，即使是蚊虫叮咬了这个人，再到其他的人，往往不会造成流行性乙型脑炎的传播。
所以，流行性乙型脑炎最主要的传染源是三带喙库蚊，还有猪和涉水的鸟类，也是这个病毒很重要的宿主和载体。流行性乙型脑炎通常好发的季节，是夏季还有秋季。
