肾活检后多数情况下不会留有后遗症，但偶尔也会出现严重情况。肾脏活检绝大部分采取的方式为针穿活检，通常穿刺针较细，为微创操作，即针穿刺进去后取出较细的长条组织，通过组织明确病理。
大多数情况下，不会扎到重要血管，穿刺完成后局部创面、伤口，可在较短时间即1周左右完全愈合。到1个月左右可完全恢复到穿刺前状态，所以肾穿活检通常没有较多后遗症，不会出现严重情况。
但偶尔会出现严重情况，如穿刺时既刺入动脉又刺入静脉系统，此时可能因动脉、静脉压力不同，而产生动静脉瘘。动静脉瘘产生后，可能会引起患者出现反复血尿等情况，此种情况较为严重。
