临床肛瘘和痔疮可以同时手术，手术成功率较高，但与医者技术密切相关，整体原则是不影响肛门括约功能、不使局部瘢痕生成过多。目前技术较为成熟，手术治愈率较高，临床效果相对较好，患者不必过于担心，但手术可能遗留并发症。肛瘘由肛门腺体感染发展而来，大部分肛周感染以后生成脓肿、破溃形成肛瘘。肛瘘和痔疮属于两种疾病，肛瘘治疗目的是切除瘘管，治疗比痔疮复杂，一旦确诊肛瘘以后需要手术治疗。
痔疮如果没有症状表现，不出现便血、不脱出或症状较轻，可以进行保守治疗，但出现反复便血和脱出时，在进行肛瘘手术时可以将痔疮同时切除。手术时肛瘘和痔疮治疗需要分清轻重主次，一般需要两者同时兼顾，且不引起肛门狭窄和瘢痕过多，同时需要防止肛门湿疹，综合平衡设计才能避免术后引起严重合并症。
