咽拭子是用一根大约20公分长的棉棒，前端有由特制胶质组成的头，表面粗糙，在摩擦咽部时，可以把脱落细胞给划掉，粘到咽拭子头端，是用来取得咽腔细胞的一种工具，是病毒或者细菌检查的一种方式。当需要获得咽腔寄生菌，或者感染引起的病毒、细菌等病原体，就要用到咽拭子。

操作时在咽的上壁、后壁、左侧、右侧多次摩擦，擦拭之后，咽拭子头端就沾满脱落细胞以及病原体，有些病原体在脱落细胞内部，进行细菌检查就会送到检验科，在细菌培养皿上接种。

如果检查病毒，会从咽拭子的头端提取病毒DNA进行检测，比如流感、副流感病毒等病毒检测都是使用咽拭子的方法，提取病毒DNA进行检测。