宫颈上皮内瘤变Ⅱ级在临床上通过P16免疫组化的结果进行管理。宫颈上皮内瘤变Ⅱ级，P16免疫组化如果为阴性，在临床上会参照低级别病变进行管理。当宫颈上皮内瘤变Ⅱ级，P16免疫组化是阳性时，会参照高级别病变进行管理。所以宫颈上皮内瘤变Ⅱ级，也是干预治疗的阈值。年轻女性有生育要求，经过医生评价具有生育能力，如果组织病理学明确为CINⅢ，建议治疗。组织病理学为宫颈上皮内瘤变Ⅱ级或并无明确指出级别的患者，可每6个月进行细胞学与阴道镜检查再评估。

在观察过程中，如果宫颈上皮内瘤变Ⅱ级或Ⅱ-Ⅲ级病变持续存在24个月以上或阴道镜检查为Ⅲ型转化区，即转化区不可见的情况或者病变面积增大，阴道镜评估病变比之前有加重的情况，均应给予治疗。宫颈上皮内瘤变Ⅱ级，免疫组化P16阴性，大多数因人乳头瘤病毒高危亚型一过性感染所致。60%病变可自然消退，30%病变持续存在，大约10%病变会进展为高级别病变。具体治疗方案，要根据患者年龄、生育要求以及阴道镜检查满意程度，进行个体化治疗。