腹部CT能够查出肠道中的病变，但这也预示着病变已到很严重的程度。因为能从CT中看出肠道的病变，相当于肿瘤已经生长很大或肠梗阻到一定程度。对于肠道疾病，最合适的检查方式是肠镜以及上、下消化道的造影，这些检查才是诊断肠道疾病的最核心内容。
肠道疾病的诊断，一直在研究尽量用无创的方式来进行。根据现在掌握的情况，内窥镜能最清楚的看到病变情况。此外诊断也分不同途径、多种方式，包括血液检查、肉眼观察、影像学检查等各种诊断手段。
单凭一种诊断方式较少，更多都是根据病史以及多个检查结果，还有能直接观测的内窥镜等，综合分析后才能做出最准确的病变诊断。
