颅内感染的抗生素，需要结合致病菌来进行选择，所以在颅内感染发生的时候，会给病人进行腰穿留取脑脊液，进行病原微生物的培养，最终抗生素的选择根据病原微生物的类型，还有药敏试验来选择敏感的抗生素。
在药敏试验没有出来之前，可能会对脑脊液，进行涂片，区分是革兰氏阳性还是革兰氏阴性细菌的感染，来经验性的选择一些抗生素，具体如下：
1、细菌感染引起的颅内感染：选择的抗生素有三代头孢类，并且能够通过血-脑屏障，如头孢曲松、头孢唑肟等这些抗生素来治疗颅内的感染；
2、结核杆菌引起的颅内感染：这个时候，就需要选择联合应用一些抗结核的药物，比如异烟肼、利福平等来治疗结核性脑炎；
3、真菌感染引起的颅内感染：如隐球菌感染，这样的情况下，可能需要选用一些治疗真菌的药物，比如制霉菌素B等来进行颅内感染的治疗。
