手足口病一般根据不同的病原，潜伏期有一定差别。具体如下：
1、柯萨奇病毒目前的潜伏期基本上在2-7天，有的长达2-10天，平均3-5天；
2、EV71病毒的潜伏期为2-8天。
患者在潜伏期内没有任何症状，任何病原体从感染到人体出现可以检测到，比如抗体，临床表现这一段时间称为潜伏期。手足口病这段时间较短，平均3-5天，一旦出现临床症状以后，就是过了潜伏期，一般2-7天或者3-5天的潜伏期。部分病人在临床上较难察觉，一部分人没有症状，甚至疱疹性咽峡炎症状较轻，为一过性，临床监测到症状时，或者血液系统还需经血液科能检测到这些症状、体征和标志物时，也已经过了潜伏期。
