大多数支原体感染没有症状，都是在检查尿液、精液或者涂片时，发现有支原体感染，尤其是男性。只有少数的尿道炎感染是由支原体感染导致，可能与性病有关，比如非淋菌性尿道炎，从尿道的分泌物中能够找到支原体。
很多男性检查出支原体，并没有症状，比如做精液培养或做尿道拭子的培养发现，支原体可能在生殖道或者泌尿道正常寄生，不会产生症状。所以，也不一定需要治疗。支原体感染如果有症状，比如引起尿道炎或影响男性的精液质量，可以进行治疗。
通常采用抗生素治疗，比如萘胺霉素、阿奇霉素、喹诺酮类等，一般服用2周左右就能消除。但是有些支原体感染容易复发，甚至有部分人通过一段时间治疗持续存在。一般只要没有症状，没有对身体造成影响，可以不用特意消除，如果有症状应该将其消除，来缓解症状。
