肾盂肾炎临床可分为急性肾盂肾炎和慢性肾盂肾炎，慢性肾盂肾炎患者门诊治疗即可，不需要住院治疗。而对于急性肾盂肾炎患者，一般要求住院治疗。因为急性肾盂肾炎不仅有泌尿系局部的感染症状，也会有全身感染症状，局部症状常见尿路刺激征或者合并有腰痛。全身感染症状主要是寒战、高热，体温可高到38.5℃，同时伴有恶心、呕吐、头痛等症状。一般建议患者尽量住院治疗，因为持续发烧可能会出现败血症。住院治疗可做一系列相关检查，比如血常规、尿常规、尿培养，体温高到39℃以上做血培养。
治疗选取有针对性的药物进行治疗，可做到治疗更加精准，治疗效果也会更加好。一般急性肾盂肾炎患者会给予特殊针对性的治疗，包括补液治疗、退热治疗、抗生素治疗。抗生素治疗根据经验首选喹诺酮类抗生素，在患者留晨尿培养后，根据尿培养结果选取更有针对性的药物进行治疗。同时还可配和中药治疗，比如一般急性肾盂肾炎常见的是湿热下注的患者，可用采用清热利湿的中药，如八正散加减，清心莲子饮的治疗，清心莲子饮加减，都可达到不错的效果。