泌尿系统结石发生的部位，可以发生在尿路的任何部位。通常把尿路分成了上尿路和下尿路，而上尿路包括肾和输尿管，下尿路则包括膀胱和尿道。而结石位于不同部位的时候，可以分为肾结石、输尿管结石、膀胱结石和尿道结石，因此结石是可以存在于尿路的任何一个部位。

而在具体的情况下，在肾脏时，通常位于集合系统内，包括肾盂、肾盏。只有极少数情况下，可以发生在肾室之内。还有输尿管结石主要位于输尿管腔内，膀胱结石则位于膀胱内。而尿道结石通常嵌顿在尿道内，可以分为后尿道，也可以分为前尿道。

在结石发生以后，往往需要根据结石的大小、部位、质地及合并的问题，还有患者的自身情况，选择合理的治疗。泌尿系统的结石治疗，可以分为自行排、体外碎石以及手术治疗。目前对于较小的上尿路结石可以行自行排石，对较大的结石则需要通过体外碎石或者手术治疗进行处理。总体上，目前手术治疗都是以内镜治疗为主。