做咽拭子检查主要采集的是扁桃体以及咽喉部的分泌物及上皮细胞。可以根据所采集的这些东西获取病原微生物，对标本进行一定的培养或者病毒的分离，再就是脱落细胞的检查。

通过咽拭子的检测，主要是针对于呼吸道常用的一个检测手段，尤其是新冠肺炎时，经常都是通过咽拭子进行采集。除了新冠肺炎要进行咽拭子检测之外，还有例如白喉、化脓性扁桃体炎，还有急性咽喉炎、流感、结核病以及真菌感染、肺炎支原体这类感染等。

因而一般进行咽拭子检查，应该先是消毒、漱口，以免咽部或者口腔内带来的其他杂质发生影响，需要尽量避免。检测时由于向后去探查咽部，所以有些人咽反射比较重，出现恶心、呕吐，但是一般情况下，在做咽拭子时应该提前两个小时就不再吃东西。