胃肠间质瘤不同于胃癌、结直肠癌，胃肠间质瘤对化疗不敏感，因此患者不需要化疗。胃肠间质瘤的治疗方法主要分为手术和靶向药物两种，患者在完善相关检查后，临床医生通过综合评估胃肠间质瘤的部位、大小、可否切除，以及是否有远处转移等因素，制定最佳的治疗策略。胃肠间质瘤的治疗首选外科手术切除，主要是指通过开腹或者腹腔镜手段进行肿瘤切除。但晚期胃肠间质瘤患者手术效果不佳，术后转移及复发率比较高，达到80%。
过去的20年里，随着多款靶向药物的问世，胃肠间质瘤的治疗获得突破性进展。在手术切除后的辅助治疗中，服用靶向药物能延缓复发，提高患者的生存率，对于暂时无法切除的肿瘤，患者可以通过口服靶向药物缩小病灶，创造更有利于手术的条件。目前我国获批胃肠间质瘤适应证的靶向药有5个，分别是一线的伊马替尼、二线的舒尼替尼、三线的瑞戈非尼、四线的瑞派替尼，以及针对D842V突变的阿伐替尼。但具体治疗方案请结合临床，由医生面诊指导为准。
