脑部的彩超跟核磁的区别很大，具体区别如下：
1、彩超：颈部血管超声主要可以观察颈部动脉粥样硬化斑块、评估颈部血管狭窄情况，及对血流情况进行评估。如是颅内经颅多普勒，可以对大血管如大脑中动脉、大脑前动脉血流速度、血流方向进行监测，此外超声还可以对微栓子进行监测及评估，脑血流速度、血管狭窄及血管痉挛都可以进行评估；
2、核磁：脑核磁可以对脑血管形态，如是否有些局部狭窄进行显示。除此之外，还可以对脑的结构进行显示，这是血管超声做不到的。如核磁不同序列，T1加权像可以看到正常的脑组织结构，T2会对病变结构进行显示，FLAIR成像可以对脱髓鞘、脑梗的病灶显示更清楚，T2start或SWI对于脑内出血、陈旧出血特别敏感。
核磁和超声在显示的不同方面各有优劣，需要结合检查的目的，来进行特征性选择。
