慢性乙肝目前治疗方法较多，如抗病毒治疗、抗炎保肝治疗、免疫调节治疗。其中最主要的治疗为抗病毒治疗，但存在一定适应症，若病人肝功能反复异常，乙肝病毒DNA阳性，年龄30岁以上，该情况下建议抗病毒治疗。
若病人患有乙肝肝硬化，建议长期抗病毒。病人若肝功能正常，但乙肝病毒DNA阳性，并伴有乙肝、肝硬化或肝癌的家族史，这种情况下建议抗病毒治疗，但并非所有病人均适合用抗病毒的方法治疗。若患者原来为乙肝，肝功能正常，但近期第一次出现肝功能异常，可采用抗炎保肝，再定期随访肝功能情况。
如果经过这次治疗以后，肝功能维持一段时间，暂时可以不抗病毒。如果这次抗病毒以后，肝功能还是反复发作，这种情况下再采用抗病毒治疗方法，因为抗病毒治疗涉及到长期过程，20岁左右的患者还涉及到工作、生育等问题，情况因人而异。
