肺结核如果能够早期发现、及时诊断、规范的化学治疗，一般预后良好。初治的肺结核患者给予及时规范的治疗，治愈率可达85%以上，复治的肺结核患者经过规范治疗，治愈率也可达75%以上。但一些不规则服药、不按医嘱服用药量、过早停药的患者，治愈率不到50%。如果患者的痰菌是阳性，又拒绝接受抗结核治疗，5年内的死亡率可高达50%。不规则用药可诱发细菌产生耐药性，导致病情加重甚至死亡。
耐药肺结核，尤其耐多药的肺结核患者预后较差，目前全球的治愈率大概在50%左右。如果肺结核合并有糖尿病或艾滋病等免疫力低下的疾病时，它的治疗难度将进一步加大。肺结核患者治愈后的复发率大概在2%-5%。为避免复发，治疗期间要谨遵医嘱、坚持服药、完成全疗程治疗，治愈后要注意养成良好的生活习惯、保证营养、适当锻炼、提高自身抵抗力，还要定期复查。
