甲状腺功能五项指的是游离T3、游离T4和促甲状腺激素，这三项跟激素功能相关，另外两项是甲状腺相关抗体，包括甲状腺球蛋白抗体和甲状腺过氧化物酶抗体，统称甲状腺功能五项。通过前面三项游离T3、游离T4、促甲状腺激素这三项检查，就可以判断这个人是有甲亢还是甲减，是原发还是继发，病变是在甲状腺还是在垂体。通过这三项检查就可以做这样的判断。
另外两项甲状腺相关的抗体检测，主要是为了帮助判断甲状腺发生了什么问题。如甲状腺过氧化物酶，如果是阳性就判断可能会存在有慢性桥本甲状腺炎，如果是甲状腺球蛋白单项阳性，可能怀疑有亚急性甲状腺炎或无痛性甲状腺炎，或产后甲状腺炎。根据不同的抗体谱，能够对甲状腺炎的病因做鉴别，这个五项统称为甲状腺功能五项。
