活动性乙肝意味着病毒复制活跃，同时意味着机体对病毒复制产生的免疫应答也活跃。乙肝病毒本身对肝脏没有毒性，至少是低毒性，但是一旦产生免疫应答，免疫杀伤不分正常肝细胞和病毒。所以活动性意味着机体和病毒互相斗争激烈，这时对肝脏炎症杀伤较激烈。所以慢性活动性的肝炎相对于静息期或者免疫静止状态的乙肝感染携带者，患者的肝脏严重程度，损伤严重程度严重。并且也是肝硬化、肝癌、肝纤维化发生过程中的重要因素。反复炎症活动会造成纤维增生，组织修复过程中纤维增生越来越重，少数患者会诱导肝癌的发生。
所以慢性活动性乙肝相对于其它静息期或者携带状态，其对肝脏的损伤较重。少数慢性重症肝炎，如有些患者在慢性活动过程中突然加剧，造成肝脏严重坏死，或者重症肝炎的发生都是在慢性、活动性乙肝基础上发生。所以从这两个角度判断，慢性活动性的乙肝对肝脏的损伤较重，也是其不良后果的主要诱因。