肾结石在CT影像上，典型表现是肾脏集合系统内，可以看到CT值较高的亮点，大约与骨骼CT值相似。肾结石用CT平扫来进行观察，可以看到肾结石大小，也可以看到肾结石分布，位于肾盏还是肾盂内，结合CT三维成像，可以精确定位在哪个肾盏或者在哪个肾小盏。
CT值也可以表示肾结石密度或者坚硬程度，肾结石的CT值大多数是300-1800HU，含钙量较少，例如尿酸结石一般密度较低，CT值大多是300-500HU，草酸钙结石钙含量较高，可以达到1000HU以上，通常磷酸钙结石CT值也会偏高。
手术前进行CT肾结石定位较为必要，尤其是结石较小或者位于某个肾盏内手术时，找结石通常花费时间，而术前进行精确CT定位，有助于输尿管镜做肾结石手术时，快速准确找到结石，并且避免遗漏。肾结石在CT上的表现要注意和钙化相区别，例如肾髓质钙化、肾乳头钙化或者是肾结核钙化，上述位置和结石位置有差别。结石多数是在尿路集合系统内钙化，钙化多数位于肾实质内，要注意区分。
