肾结石的手术目前常见有输尿管软镜手术、经皮肾镜手术，以及开放手术和腹腔镜手术，临床上主流的术式是输尿管软镜或者经皮肾镜的手术。而开放手术或者腹腔镜手术目前应用得很少，只适用于需要同时处理其他泌尿系统问题的时候，具体如下：
1、输尿管软镜手术：从手术的情况来看，输尿管软镜手术由于存在碎石效率和排石效率的问题，一般适用于较小的结石，即肾结石＜2cm的时候；
2、经皮肾镜手术：较大的肾结石比较适合经皮肾镜手术。
无论是输尿管软镜手术，还是经皮肾镜手术，最大的手术风险来源于感染，脓毒血症是最大的并发症，可能会对患者的生命形成威胁。输尿管软镜手术与经皮肾镜手术相比，引起出血概率相对较小，因为其并非直接肾损伤。而经皮肾镜手术有肾脏穿刺的情况，可能会造成出血，严重的出血需要抢救，行动脉栓塞或者肾脏的修补，甚至肾切除手术。
