女性肾囊肿通常不会影响生育。女性泌尿系统和生殖系统分属于两个系统，尤其肾囊肿本身是一种良性的病变，不会影响生殖系统的病变。肾囊肿大部分都为良性，而且对肾脏也不会造成过大影响。但囊肿比较大，4-5cm时压迫肾脏会导致肾功能不全，或压迫肾盂、输尿管导致肾积水，会影响肾功能。根据B超和CT等影像学检查，可以评估肾囊肿是否严重，Bosniak分型如下：

1、Ⅰ级：单纯性囊肿属于良性的病变，如果囊肿并不大时，通常不需要特别的处理；

2、Ⅱ级：复杂性囊肿，而且囊壁比较薄，未伴有强化时，可能也是良性的病变为主，因此也不需要特别的处理，可以进行随访；

3、Ⅲ级：复杂性囊肿，而且囊壁比较厚，伴有囊壁的强化时，会有恶性的可能，因此需要外科干预；

4、Ⅳ级：囊肿旁边有软组织的肿块，是囊性肾癌的表现，属于恶性肿瘤，需要外科的干预和治疗。

综上所述，囊肿通常都属于良性的病变，尤其是Ⅰ、Ⅱ级的肾囊肿，不需要特殊的处理，Ⅲ、Ⅳ级的肾囊肿，则需要相应的外科干预。