患者应该了解导致结膜炎和角膜炎的病原体，针对病因进行治疗，具体分析如下：
1、细菌性结膜炎或者细菌性角膜炎：首当其冲是抗生素的使用，在早期会频繁点用抗生素眼药水控制炎症，若炎症不能得到控制，还要审视使用的抗生素是否对此类细菌不敏感。患者应局部选取病原体活检，即蘸取睫毛囊的分泌物或者刮取角膜炎病灶周围的组织，检测细菌感染类型，找到敏感的抗生素进行治疗，一般广谱抗生素可以控制绝大多数的细菌性结膜炎和角膜炎；
2、病毒性结膜炎和病毒性角膜炎：需要应用抗病毒眼药水，严重患者可能同时需要口服抗病毒药物，帮助控制病毒繁殖，使得病毒性结膜炎、角膜炎减少复发。而病毒性的结膜炎有自愈过程，2周左右，病毒性结膜炎没有继发其它病毒或细菌感染，则能够自行好转。病毒性的角膜炎则需要配合医生进行药物干预治疗。
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