扁桃体癌的生存率与扁桃体癌的类型和发现早晚有关。扁桃体癌有比较关键的指标，是否是HPV病毒阳性。HPV病毒感染阳性，扁桃体癌愈后相对好很多，5年生存率比较高，对放化疗的反应也比较敏感。
一般扁桃体癌做活检后，常规做HPV病理检查，用来反映HPV的病理指标，主要是P16。假如病理报告里P16阳性，代表着扁桃体癌预后比较好，生存率比较高，当然具体生存率需要根据发现扁桃体癌的早晚判断。
如病变是T1、T2、T3、T4，有没有发生淋巴结转移，但不论是哪种情况，只要是HPV阳性，都比HPV阴性病人生存率要高。一般早中期的生存率达到80％-90％，中晚期应该达到70％-80％。
但是HPV阴性的患者，相对同等情况下生存率会降低，可能需要手术加综合性治疗的几率就更高。假如怀疑扁桃体癌，要找医生做准确评估。
