肾病综合征常见并发症也是最严重的并发症，主要为血栓。因为肾病综合征血浆白蛋白降低以后，出现大量浮肿，血液黏稠度大幅度增加，可以影响代谢紊乱，影响凝血因子变化。所以肾病综合征患者的血栓形成较为容易，尤其是心、脑、肺等大脏器，器官存在血栓可以危及生命，可以发生下肢静脉血栓以及冠状动脉血栓，导致心梗以及脑血栓，甚至出现肺栓塞，导致猝死。所以肾病综合征需要防治并发症，以及并发症治疗当中需要密切监测肾病综合征的并发症。临床使用抗血小板聚集药以及抗凝药物，甚至应用溶栓药物以防止严重血栓形成。

而肾病综合征重要并发症则为急性肾衰，尤其是见于大量浮肿患者可以出现急性肾功能衰竭。急性肾功能衰竭患者首先可以出现肌酐、尿素氮增高，大量浮肿同时合并心功能衰竭。所以肾病综合征防治浮肿的原因、治疗浮肿，利尿的消肿同时，要保护肾功能和心功能，甚至严重肾病综合征患者并发症出现以后，需要进行强化利尿治疗，进行血液透析以及老年人多脏器损伤以后，需要进行床旁血滤保护肾功能以及心功能，以免发生更严重的不良事件。