脑积水根据成因不同也有不同的治疗方法，主要有以下两种：

1、脑室腹腔分流术：将引流管一端放在颅内，另一端像鱼缸换水一样塞在腹腔里，在皮下走行分流管，达到闭合的效果，让大脑分泌出的多余的脑脊液通过引流管引入腹腔，通过腹膜大面积的半透膜来吸收。这种治疗方法适合于各种脑积水的治疗，但也有弊病，即在早期两年之内发生堵管、感染、排异的比率在40%左右。现在随着技术的不断完善，引流管材质也在不断改善，包括用抗生素浸泡的引流管，但并发症的发生率也在35%左右，两年之后趋于稳定；

2、内窥镜第三脑室底造瘘术：适应症比较窄，仅适用于机械性梗阻，即在脑室流出道最窄处，大概1.2mm左右的中脑导水管段如果出现炎症的闭锁、粘连，或者是肿瘤的生长压迫导致闭锁，脑脊液由于机械梗阻无法流出，引起脑室变大。可以通过内窥镜第三脑室底造瘘改变流动出口，让脑脊液从第三脑室底开口再回到脑表面进行循环。此手术的好处是不改变生理结构，并发症少，但适应症窄，只适用于梗阻性脑积水。