先天性角膜白斑可以达到临床治愈，主要是通过角膜移植的方法治愈。角膜白斑一旦形成，角膜基质层的瘢痕通常比较深，必须要达到角膜基质层厚度的1/2以后，才能形成角膜白斑。角膜的瘢痕愈合，有角膜云翳、斑翳、白斑几种类型，其中角膜瘢痕比较轻，即在角膜基质层的1/4时，一般形成角膜云翳，而角膜白斑是达到角膜基质层1/2以上形成。在角膜基质层的瘢痕愈合1/4-1/2时，称为角膜斑翳，即斑翳为中等程度的角膜瘢痕愈合。

先天性角膜白斑通常合并有青光眼、白内障或眼内组织缺损，因此先天性角膜白斑不但要进行角膜移植，还要同时处理其他问题。因此当合并有白内障、青光眼或眼内组织缺损，即眼内其他问题时，角膜白斑处理更为棘手。单纯的先天性角膜白斑比较容易处理，只需要通过穿透性角膜移植或深板层角膜移植，即可达到完全治愈。先天性角膜白斑形成的原因，主要是由于胚胎期体表外胚层与晶状体泡没有完全分离或瞳孔膜与角膜发生粘连造成。