氟康唑是治疗女性霉菌性阴道炎常用的药物，毒副作用较小，普通的药物危害通常较小。如果在妊娠期或哺乳期需用氟康唑，其危害较小。此药在哺乳期基本上慎用，在妊娠期虽然禁用，但也不属于危害非常大的药物。特别注意在孕早期尽量不要用这样的药物。
口服药物治疗霉菌性阴道炎，通常是因为女性没有性生活，阴道上药不方便。如果已经有性生活，阴道上药方便，阴道使用抗霉素，毒副作用会更小，局部用药吸收到全身较少，对胎儿或新生儿的影响也较小。氟康唑属于普通药物，危害性较小，在哺乳期、妊娠期并不是绝对不能用，但如果患者具备阴道上药的条件，通过阴道局部上药克霉唑，治疗阴道炎更合适些。
