腔镜手术与传统手术相同，而且具备比传统手术更好的局部美观效果。腔镜手术与甲状腺传统的开放手术相同，均可能引起喉返神经损伤，患者可出现声音嘶哑；还有喉上神经损伤，可表现为饮水呛咳；亦有可能出现甲状旁腺损伤，出现术后手足抽搐、低钙表现。上述均不属于腔镜手术特有的并发症。

腔镜手术并发症可表现为高碳酸血症、皮下气肿等，但是以上都不是主要的问题。目前我国腔镜技术较成熟，只要腔镜手术的适应症比较适合，均可采取此手术方式。