碎石后患者仍然疼痛通常有以下几种原因：
1、碎石效果较差：碎石手术后结石并未碎开，尤其是体外碎石术。对于较大或较坚硬的结石，一次手术并不一定能够完全碎开结石，较大的结石仍然梗阻在输尿管或肾脏当中，会导致患者出现疼痛和感染；
2、石街形成：碎石手术后结石碎块陆续排出，在排出过程中，仍然会对输尿管构成一定的刺激。如果碎块堆积，容易形成石街，对肾脏或输尿管仍然有一定的梗阻效应，导致患者发生疼痛，甚至部分患者需要继续碎石或手术，才能缓解疼痛症状；
3、存在其他结石：部分患者的结石不一定为单发结石，虽然通过碎石手术后将结石击碎，但是体内仍然存在新的结石刺激身体，结石从肾脏掉入输尿管中导致发生新的疼痛；
4、并发症：碎石手术会对部分患者的局部造成一定的创伤，同时伴有感染，导致患者出现疼痛。
如果患者进行碎石手术后仍然存在疼痛，需要通过B超或CT检查明确病因，再进行针对性处理。比如重复碎石、手术、抗感染治疗或者是对症止痛，解痉治疗等，才能最终解决患者的不适症状。
