输精管刺痛最常见于慢性前列腺炎，病人发生慢性前列腺炎时，由于感染性致病微生物刺激前列腺部尿道黏膜，导致前列腺部尿道黏膜红肿、糜烂，还会引起前列腺腺体炎性肿大，致病微生物还会引起精液感染，导致输精管发炎，出现输精管走行区隐痛或刺痛症状。病人还会出现附睾发炎、睾丸坠胀不适症状。

输精管刺痛还见于精囊炎病人，病人发生急性精囊炎时，也会出现输精管走行区隐痛或刺痛症状，病人还会出现精囊黏膜破损出血、血精症状。病人出现上述症状时，需及时到男科或泌尿外科就医，通过精液细菌培养，通过精液支原体、衣原体培养，通常能找到致病微生物。通过选择有效的抗生素配合中成药物联合治疗，多数病人输精管刺痛症状会明显好转。