针对男性生殖器官，体内维生素B₂充足的重要作用是避免发生阴囊炎，对阴茎作用并不明显。如果维生素B₂缺乏，即核黄素缺乏，可导致阴囊炎发生。阴囊炎和阴囊湿疹是一类疾病，只不过阴囊炎会倾向于维生素B₂缺乏，患者可出现明显局部刺痒，甚至肿胀、渗液，抓挠以后局部皮肤肥厚，症状会更加严重，阴囊上可见红斑样皮损。

对于阴囊炎的处理方式主要为补充维生素B₂，此外可以应用对症处理的药物，如黑豆馏油、硼锌糊等，以及在医师的指导下应用类固醇激素类软膏。生活时要注意避免热水清洗局部患处，可以用冷水清洗或者冷水湿敷，避免辛辣刺激食物摄入，以免加重症状，可以适当摄入富含维生素B₂的食物。