如果是甲状腺功能亢进症导致的甲状腺合成及分泌甲状腺激素增多，这时需要使用抗甲状腺药物进行治疗，常用的有甲巯咪唑和丙硫氧嘧啶。使用药物期间要严密监测血常规、肝功能、甲状腺功能，定时、定期调整药物剂量，如果出现药物副作用，应该及时停用药物。
甲状腺功能亢进症可以选择放射碘-131治疗，有压迫症状的巨大甲状腺，可以选择手术治疗。如果不是由于甲状腺功能亢进症导致的甲状腺激素水平升高，而是由于甲状腺滤泡上皮细胞破坏导致的一过性甲状腺激素水平升高，不需要使用特殊的抗甲状腺药物进行治疗，如桥本甲状腺炎、亚急性甲状腺炎等。一过性的甲状腺激素水平升高称为一过性的甲状腺毒症，随着病情进展与改善，甲状腺激素水平可以逐渐恢复正常。
