胃肠间质瘤肝转移晚期能否活5年，存活时间更多是根据患者的术后对于药物的反应的情况来决定。本人手上就有治疗的患者，初始就发生腹腔的转移，包括肝脏转移，病人现在已经存活六七年了，还是一个健康的存活状态，但是也有在5年之内，复发转移就去世了。所以认为存活的时间，更多的取决于患者术后，对于药物的治疗反应，或者说耐药的发生情况。

因为转移并不可怕，因为胃肠道间质瘤本身是一个肉瘤，肝脏器官是转移最常见的部位，所以一旦术后发生了转移，可以通过转移灶的基因检测，来决定术后的用药。术后现在靶向药物已经有了一线、二线、三线、四线，有更多的选择，所以根据基因检测的结果，来选择相应的用药。即使选择一线药物以后，应用1-2年以后，可能又会出现耐药，耐药以后，可能可以通过二线、三线的用药，来对转移灶进行治疗。而且目前不光是药物的治疗，包括介入射频，也有一些其他的方式。所以一旦发生了转移以后，还是建议在专科专业的医生的指导下，进行规范治疗，尽量地获得较长的生存时间。