对于脑出血和脑血栓形成的鉴别的依据，最直接的就是在急性期进行头部CT检查。脑出血急性期在头部的CT上，可以表现为密度增高影。在CT上是白色的病变，可以见于脑叶或者是脑干等部位。
脑血栓的形成在急性期，是缺血性的改变。在发病比较短的时间内，CT上的表现可能会表现为，脑叶皮质和髓质交界区界限的不清楚，还可以有脑组织的肿胀、沟回的消失。随着时间的延长，在CT上可以看到密度较低的病灶，颜色偏于黑色，比较发黑。此情况往往就提示是脑血栓形成，是脑的缺血性改变。
所以对于脑出血和脑血栓形成，在影像学方面的鉴别，在急性期，CT是比较直观的检查。如果对于慢性期的改变，要鉴别病灶是脑出血或者脑血栓形成，可以通过核磁进行检查。
在核磁的T2star或者SWI项，脑出血的病灶往往会有铁质的沉积，会出现黑色的点状病灶，也是比较特征性的改变。
