碎石对机体的危害，主要是对结石周边脏器结构的损伤，具体如下：

1、肾脏损伤：激光碎石在医学上用的能量称为冲击波，隔着肾脏、脂肪打结石，对于结石的损伤最大。但如果频繁，或能量过高，可造成肾脏的包膜下出血。特别严重的，如病人曾有过肾炎，还易造成肾脏破裂，这也是碎石最危险的一点；

2、感染：部分结石为感染石，结石内含有细菌，体外击碎结石后，细菌也随之而出，容易造成相应的细菌毒素，或者细菌入血，严重者甚至可造成感染中毒性休克；

3、泌尿系统症状：碎石本身是冲击石头，在结石碎渣排出过程中，可能产生血尿、尿频、尿急、尿痛等不适；

4、心脏起搏器：有心脏起搏器的患者应慎做碎石手术，需由专门的心内科大夫，调整碎石机器，否则体外震波频次可能干扰心脏起搏器的正常运作。