通常不建议成人长期吃益生菌，否则不利于人体体内的菌群平衡。消化道里有益生菌和不良的杆菌，通常情况下，不良的杆菌以革兰氏阴性杆菌为主，包括大肠埃希菌、大肠杆菌、粪球菌等，通常称为肠道内有害的病原菌，与益生菌的作用相反。
正常的成年人在体内有一定益生菌和有害菌同时存在，此时达到一个菌群的平衡状态，所以不会出现明显的腹胀、腹痛和腹泻，也不会有明显的便秘或消化不良的情况。但当体内过多补充益生菌后，可能造成体内的菌群失调，部分细菌就会丧失活性，导致二次污染或再次出现真菌感染。肠道内一旦出现益生菌过多，容易导致真菌定植，在真菌感染以后，成人容易出现发热、腹胀、腹痛、便秘、稀便等临床症状和反应。
