在皮肤病中甲病有几十种，许多甲病临床上非常相似，如甲板增厚、变黄是银屑病引起的还是甲真菌病引起的，白甲是真菌引起还是其它病所导致。许多患者不适当治疗延误病情，增加了经济和精神负担，因此，正确判断甲病的性质极为重要。灰指甲属于真菌感染，产生真菌的病因较多，如手足癣、长期口服免疫抑制剂或者激素等造成抵抗力下降或者糖尿患者，或者长期手、足在水里面浸泡等都可以引起甲癣。

所以从临床上先分析患者是否有上述病史，观察甲板的变化、颜色、增厚程度、光泽、硬度等，对于患者做出初步判断，然后取病甲进行真菌检查。如果是真菌阳性，可以确诊为灰指甲，如果一次是阴性，不能绝对排除是真菌感染。真菌检查最常用的方法是直接镜检或培养。直接镜检即取病甲，用10%的氢氧化钾浸泡，在显微镜下观察，方法简单、快速，但是不能确定菌种。而真菌培养准确，可以确定菌种，但是耗时长，需要的设备较多。