胆源性胰腺炎引起原因涉及到胆源性胰腺炎的定义和概念，目前教科书和很多指南中定义是因为胆总管结石、胆囊结石、肝内胆管结石在排出过程中引起的胰腺炎叫胆源性胰腺炎，所以统称为胆石性胰腺炎。

还有一部分患者为非结石性胆源性腺炎，发病在胆胰汇合部，如十二指肠乳头、十二指肠乳头炎、乳头过长、硬化性乳头炎、萎缩性乳头炎、乳头旁憩室等引起胆胰流出道不畅。同时，患者出现低位胆液合流异常，或者高位胆胰合流异常。这部分病人在饮酒、进高脂饮食的时候，容易出现胆汁逆流到胰管，激活胰酶发生胰腺炎。

病人若是单纯取结石或者切胆囊，往往术后复发率会高，效果不理想。所以胆源性胰腺炎的发生机理是胆管胰酶被激活，通常是十二指肠液或是肠液还有胆汁激活。激活的路径是通过胆胰汇合部，胆管、胰管在乳头上有隔膜，隔膜缺失或者关闭不全情况下，肠液、胆汁容易反流到胆管，反流到胰管激活胰酶发生胰腺炎。所以对这部分病人要根据发病原因、发病机理进行治疗，即通畅胰管流出道，通过ERCP技术解决，复发性胰腺炎患者中大概90%需要通过ERCP解决。