重症狼疮性肾炎是狼疮性肾小球肾炎里到比较棘手的类型，狼疮肾炎分六个类型，如果是狼疮肾炎的Ⅲ型或者Ⅳ型，局灶节段硬化性，或弥漫增殖性的肾炎，都表现为重症狼疮性肾炎。病理上，比如病人有活动性病变，内皮细胞的广泛增生，核碎裂，白细胞浸润，或者有免疫复合物的沉积，肾小球硬化，或肾小管萎缩，肾间质纤维化，或者是病人有新月体的形成，都可以导致重症狼疮。重症狼疮治疗方面也是相对比较棘手，重症狼疮治疗分为两个阶段：诱导缓解阶段和维持期间的阶段。
诱导缓解阶段一般会用到大剂量的激素加免疫抑制剂的治疗，强的松口服治疗，同时还会应用免疫抑制剂。免疫抑制剂的选择会有经典方案与比较新的经典方案，会选用环磷酰胺等细胞毒药物，现在有很多新型免疫抑制剂，比如有霉酚酸酯、骁悉、来氟米特、钙调磷酸酶抑制剂、环孢素A或者他克莫司、硫唑嘌呤等。总的原则是在激素治疗基础上加免疫抑制剂。
在诱导阶段，总的疗程大概在6个月左右，之后进入维持阶段，激素量相对会比较小，基本在0.5mg/(kg·d)以下，再加上相对副作用比较小的免疫抑制剂。维持阶段的治疗目的主要是为减少狼疮肾炎的活动，尽可能缓解肾脏病的进展，尽可能缓解狼疮肾炎的进展，所以重症狼疮的整个治疗时间会比较长。