三叉神经痛的发病机理目前尚未清除，一般将三叉神经痛分为原发性和继发性两类，具体如下：
1、原发性三叉神经痛：即未找到明确原因，可能与三叉神经周围血管刺激有密切关系，动脉、静脉的微小的毛细血管团块刺激三叉神经，导致三叉神经异样放电，出现三叉神经的撕裂样、刀割样、闪电样的疼痛，进行三叉神经的微血管减压术，梳理三叉神经周围可能引起疼痛的毛细血管团块，90%的患者能够得到缓解，从而也证实了这种假说有理论根据；
2、继发性三叉神经痛：多数患者由三叉神经周围的肿瘤以及炎症、外伤引起，一般能够找到明确的原因。继发性三叉神经痛存在诱发因素，如牙科手术或精神压力引起，如生气、焦虑、抑郁以及兴奋，这些不良的神经刺激可诱发三叉神经痛，所以避免诱发因素是控制三叉神经复发的重要手段。
