脑内的肉芽肿性病变是否严重，取决于肉芽肿的大小、部位及对周围脑组织结构、神经结构、血管以及脑脊液循环的影响程度。
脑内肉芽肿常见于脑部寄生虫或脑内结核瘤等，这些肉芽肿周围有时会有比较明显的水肿，会形成一定的占位效应，对局部的脑组织形成刺激，可能会引起癫痫发作，也可能会引发患者肢体无力，乃至偏瘫、偏身感觉障碍。除此之外，肉芽肿还可以造成脑脊液循环的梗阻，从而引起脑积水和颅内压增高，使患者出现头痛、呕吐、视乳头水肿等一系列颅内压增高的症状。如果没有及时切除肉芽肿或进行脑脊液的外引流，患者有可能会由于梗阻性脑积水而在较短的时间内出现生命危险。
此外，还有一些肉芽肿范围比较弥散，会对整体的脑部结构和功能造成一定影响，出现一系列神经系统症状。
