肺部肉芽肿的原因较多，不同原因肉芽肿所造成的危害不同，主要有以下几点：

1、感染性肉芽肿：感染性肉芽肿主要是结核和非结核分枝杆菌、真菌等病原体引起的炎症，均可造成肉芽状性炎症，上述病原体造成的感染较为严重，如果不及时治疗，感染可扩散到全肺而引起肺纤维化、空洞，以及肺结构改变，可能影响肺部功能，引起全身炎症反应综合征，甚至引起死亡，因此危害较大；

2、非感染性肉芽肿：主要包括韦格纳氏肉芽肿、肉芽肿性多血管炎，以及隐源性机化性肺炎(COP)、结节病等。虽然上述疾病不是感染所引起，但肉芽肿性炎症的所有特征均可具有，主要是由于变态反应性疾病或感染诱发后，身体引起的变态反应性反应，在肺部进行炎症反应，而引起肺部增生、结节以及形成大的肿块硬，还有些疾病可能引起纵隔淋巴结肿大和肺内淋巴结肿大。肉芽肿性炎同样可能引起肺纤维化，可能毁坏肺部血管而引起肺动脉高压，严重时同样可引起呼吸衰竭。非感染性肉芽肿同时也是全身炎症反应综合征的一个方面，也可能引起全身炎症反应、血管以及其它地方的肉芽肿性炎。

因此所以发现肺部肉芽肿后，患者需及时治疗，如果不能及时治疗，同样可能损害健康、损害肺功能，还可能损害生命安全。