在所有针灸适应证的疾病基础上，五行针灸都适宜治疗，临床上针灸适应证常见的是失眠，部分患者情绪的障碍、焦虑、抑郁以及疼痛等病变，都可以使用针灸或五行针灸治疗。五行针灸起自黄帝内经，中医认为的五行包括木、火、土、金、水，是在自然界中占主要地位的5种物质。五行针灸在上世纪的中叶传到欧洲，在欧洲发扬光大，近些年又传回中国，所以五行针灸在国外应用相对比国内更广泛。

五行针灸与针灸主要的区别是以五行为基础，针灸常用的是经络辨证方式，在结合八纲辨证等辨证基础上采用针灸治疗。针灸常见的处方，如肝肾阴虚、足太阴、脾经等问题，之后选择对应的相关穴位、脾经穴位，都是依据八纲辨证、脏腑气血、阴阳失调以及经络辨证来循经取穴。而五行针灸是以五行为根基进行取穴，所以五行针灸在临床上治疗的核心适应证，与普通针灸差别较小，普通针灸能治疗的核心疾病，五行针灸也可以治疗。