对于直径小于6mm的女性尿道结石，大部分可以通过喝水、排尿、活动，或者经双合诊用指腹压迫的方法将结石排出体外。因为女性尿道直且短，很不容易存留结石，大部分都是在手术前经过超声或者影像学检查，怀疑是女性尿道结石。
女性尿道结石大部分是由于输尿管囊肿或者是膀胱憩室合并结石，需要通过内腔镜如膀胱镜，以及碎石机和激光将结石粉碎以后取出体外。在治疗结石的同时，还要把输尿管囊肿给一并治疗。
如果合并有憩室而且结石合并感染，还要一并治疗感染，必要的时候，在治疗膀胱结石或者尿道结石的同时，将膀胱憩室一并治疗。所以对于手术前怀疑是女性尿道结石的患者，首先要通过各种检查来鉴别是不是确诊为尿道结石，以避免手术中准备不足而影响治疗效果。
